どれがいいのでしょうか?
インターネット経由で利用する現在主流の形態です。初期費用を抑えられ、法改正への自動アップデートや場所を選ばない利便性が魅力ですが、カスタマイズの自由度は低い傾向にあります。
PCに直接ソフトをインストールする買い切り形式です。オフラインでも安定して動作し、月額費用がかからない点が利点ですが、複数人での同時利用や法改正への対応は手動で行う必要があります。
自社内にサーバーを構築してシステムを運用する形態です。初期費用は高額になりますが、自社の業務に合わせて自由にカスタマイズでき、セキュリティも自社ポリシーに合わせて強固にできるため、基幹システムとの連携や一元化を求める中堅〜大企業に適しています。