Salesforceでカスタムオブジェクトに新しくカスタム項目を追加した際の話です。
カスタムレポートタイプを元にしたレポートの場合、新しく追加したカスタム項目が含まれていない場合があります。
その場合、「設定」の「レポートタイプ」にて、使用しているカスタムレポートタイプをクリックします。
「レイアウトを編集する」をクリックし、未使用になっている対象項目をドラッグアンドドロップして「保存」します。
上記手順により、レポートにて新しいカスタム項目が利用できるようになっているはずです。